Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpardP35396 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpardP35396 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpardP35396 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PpardP35396 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpardP35396 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpardP35396 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpardP35396 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpardP35396 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpardP35396 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpardP35396 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PpardP35396 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpardP35396 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpardP35396 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpardP35396 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpardP35396 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpardP35396 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpardP35396 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpardP35396 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpardP35396 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpardP35396 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpardP35396 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpardP35396 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpardP35396 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms