Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab20P35295 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab20P35295 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms