Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms