Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prim2P33610 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prim2P33610 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prim2P33610 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prim2P33610 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prim2P33610 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prim2P33610 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prim2P33610 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prim2P33610 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prim2P33610 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prim2P33610 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prim2P33610 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prim2P33610 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prim2P33610 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prim2P33610 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prim2P33610 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prim2P33610 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prim2P33610 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prim2P33610 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prim2P33610 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prim2P33610 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Prim2P33610 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prim2P33610 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prim2P33610 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prim2P33610 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prim2P33610 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prim2P33610 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prim2P33610 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prim2P33610 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Prim2P33610 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prim2P33610 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prim2P33610 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prim2P33610 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prim2P33610 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Prim2P33610 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prim2P33610 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prim2P33610 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prim2P33610 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prim2P33610 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prim2P33610 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prim2P33610 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prim2P33610 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prim2P33610 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prim2P33610 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prim2P33610 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prim2P33610 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms