Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc10P31257 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms