Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kif5cP28738 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms