Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrbP28704 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrbP28704 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrbP28704 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrbP28704 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms