Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Psmb9P28076 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms