Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BrafP28028 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BrafP28028 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BrafP28028 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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