Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 AC116390.1-201ENSMUST00000227975 670 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 2900076A07Rik-203ENSMUST00000180879 725 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm43869-201ENSMUST00000204742 1405 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm6586-201ENSMUST00000167028 643 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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