Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms