Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms