Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tap1P21958 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms