Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmnb2P21619 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms