Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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