Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms