Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms