Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18524 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18524 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18524 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18524 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18524 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18524 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18524 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18524 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18524 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18524 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18524 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
P18524 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18524 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18524 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18524 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18524 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18524 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18524 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms