Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpraP18052 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpraP18052 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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