Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Hoxb1P17919 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Hoxb1P17919 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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