Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spi1P17433 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms