Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gabra6P16305 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms