Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrphP15331 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrphP15331 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrphP15331 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrphP15331 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrphP15331 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrphP15331 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrphP15331 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrphP15331 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PrphP15331 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms