Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt8P11679 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt8P11679 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms