Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms