Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lamp1P11438 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms