Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb4P10284 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms