Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms