Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa9P09631 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms