Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms