Protein–RNA interactions for Protein: P07310

Ckm, Creatine kinase M-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkmP07310 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CkmP07310 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CkmP07310 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CkmP07310 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CkmP07310 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CkmP07310 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CkmP07310 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CkmP07310 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CkmP07310 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CkmP07310 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CkmP07310 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CkmP07310 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CkmP07310 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CkmP07310 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CkmP07310 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CkmP07310 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CkmP07310 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CkmP07310 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CkmP07310 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CkmP07310 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CkmP07310 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CkmP07310 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CkmP07310 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CkmP07310 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CkmP07310 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CkmP07310 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CkmP07310 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CkmP07310 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CkmP07310 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CkmP07310 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CkmP07310 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkmP07310 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkmP07310 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkmP07310 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkmP07310 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkmP07310 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkmP07310 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkmP07310 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkmP07310 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkmP07310 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkmP07310 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkmP07310 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkmP07310 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkmP07310 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkmP07310 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkmP07310 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkmP07310 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkmP07310 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkmP07310 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkmP07310 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkmP07310 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms