Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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TtrP07309 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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TtrP07309 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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TtrP07309 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
TtrP07309 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TtrP07309 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TtrP07309 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TtrP07309 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
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TtrP07309 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TtrP07309 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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TtrP07309 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtrP07309 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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TtrP07309 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtrP07309 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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TtrP07309 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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TtrP07309 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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TtrP07309 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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TtrP07309 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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TtrP07309 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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TtrP07309 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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