Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa4P06798 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa4P06798 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa4P06798 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa4P06798 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa4P06798 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa4P06798 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa4P06798 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa4P06798 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa4P06798 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa4P06798 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa4P06798 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa4P06798 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa4P06798 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa4P06798 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa4P06798 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa4P06798 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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