Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PdgfrbP05622 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrbP05622 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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