Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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H2-Eb1P04230 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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H2-Eb1P04230 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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H2-Eb1P04230 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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H2-Eb1P04230 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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H2-Eb1P04230 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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H2-Eb1P04230 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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H2-Eb1P04230 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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H2-Eb1P04230 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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H2-Eb1P04230 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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