Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01678 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01678 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P01678 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01678 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01678 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01678 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01678 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01678 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01678 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01678 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01678 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01678 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01678 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P01678 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P01678 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01678 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01678 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01678 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01678 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01678 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01678 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01678 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01678 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01678 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01678 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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