Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01655 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01655 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01655 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01655 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01655 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01655 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01655 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01655 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01655 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01655 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01655 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01655 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms