Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp8O89110 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp8O89110 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms