Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sp1O89090 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp1O89090 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp1O89090 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms