Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnkO88874 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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