Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BlmO88700 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BlmO88700 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BlmO88700 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BlmO88700 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BlmO88700 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BlmO88700 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BlmO88700 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BlmO88700 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BlmO88700 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BlmO88700 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BlmO88700 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BlmO88700 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BlmO88700 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BlmO88700 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BlmO88700 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BlmO88700 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BlmO88700 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BlmO88700 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BlmO88700 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BlmO88700 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BlmO88700 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BlmO88700 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BlmO88700 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BlmO88700 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BlmO88700 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BlmO88700 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BlmO88700 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BlmO88700 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BlmO88700 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BlmO88700 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BlmO88700 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BlmO88700 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BlmO88700 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BlmO88700 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BlmO88700 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BlmO88700 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BlmO88700 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BlmO88700 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BlmO88700 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BlmO88700 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BlmO88700 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BlmO88700 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BlmO88700 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BlmO88700 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BlmO88700 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BlmO88700 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BlmO88700 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BlmO88700 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BlmO88700 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BlmO88700 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BlmO88700 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BlmO88700 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BlmO88700 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BlmO88700 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BlmO88700 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BlmO88700 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BlmO88700 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BlmO88700 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BlmO88700 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BlmO88700 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BlmO88700 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BlmO88700 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BlmO88700 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BlmO88700 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BlmO88700 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BlmO88700 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BlmO88700 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BlmO88700 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BlmO88700 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BlmO88700 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BlmO88700 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BlmO88700 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BlmO88700 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BlmO88700 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BlmO88700 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BlmO88700 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BlmO88700 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BlmO88700 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BlmO88700 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BlmO88700 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BlmO88700 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BlmO88700 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms