Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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