Protein–RNA interactions for Protein: O88451

Rdh7, Retinol dehydrogenase 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh7O88451 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh7O88451 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh7O88451 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms