Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms