Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms