Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms