Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f6O54917 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E2f6O54917 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f6O54917 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f6O54917 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2f6O54917 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f6O54917 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f6O54917 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f6O54917 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2f6O54917 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f6O54917 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f6O54917 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2f6O54917 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2f6O54917 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f6O54917 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f6O54917 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f6O54917 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2f6O54917 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f6O54917 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f6O54917 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f6O54917 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f6O54917 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E2f6O54917 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E2f6O54917 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E2f6O54917 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f6O54917 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E2f6O54917 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f6O54917 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f6O54917 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f6O54917 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f6O54917 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f6O54917 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2f6O54917 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2f6O54917 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2f6O54917 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2f6O54917 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f6O54917 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f6O54917 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f6O54917 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2f6O54917 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f6O54917 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f6O54917 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f6O54917 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f6O54917 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f6O54917 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f6O54917 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms