Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffbO54788 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffbO54788 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffbO54788 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffbO54788 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffbO54788 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffbO54788 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffbO54788 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffbO54788 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffbO54788 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffbO54788 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffbO54788 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms