Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms