Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms